Logo
Unionpedia
Communicatie
Ontdek het op Google Play
Nieuw! Download Unionpedia op je Android™ toestel!
Gratis
Snellere toegang dan browser!
 

Sequentiealignering

Index Sequentiealignering

Sequentiealignering (Engels: sequence alignment) is het bij elkaar zetten van twee of meer biologische sequenties op zo'n manier dat gelijkenissen en verschillen tussen de sequenties duidelijk worden.

40 relaties: Acroniem, Algoritme, Aminozuur, Arginine, Asparagine, Bio-informatica, Biologie, BLAST, Boom (datastructuur), Combinatie (wiskunde), Complexiteitsgraad, Convergentie (wiskunde), Deletie (genetica), Dimensie (algemeen), DNA (biologie), Eiwitten, Evolutie (biologie), Foutpositief en foutnegatief, Frequentie, Functie (wiskunde), Fylogenetische stamboom, Geconserveerde sequentie, Genetische verwantschap (taalkunde), Heuristiek, Homologie (genetica), Insertie (chromosomen), Iteratie, Java (programmeertaal), Lettergreepwoord, Matrix (wiskunde), Matrixvermenigvuldiging, Mutatie (biologie), National Center for Biotechnology Information, Nucleotide, Opensourcesoftware, Sequentie (biologie), Soortvorming, Statistiek, Structuur, Tekst.

Acroniem

Vlag van de NAVO, de Noord-Atlantische Verdragsorganisatie INRI, acroniem van Iesus Nazarenus Rex Iudaeorum (Jezus van Nazareth, koning der joden) Een acroniem (Grieks: ἄκρον, ákron, "hoogste" of "uiterste" + ὄνυμα, ónuma, "naam".

Nieuw!!: Sequentiealignering en Acroniem · Bekijk meer »

Algoritme

Algoritme om een willekeurig veelvlak in driehoeken op te delen (in het algemeen heeft dit probleem meerdere oplossingen, de bereikte oplossing hangt dus af van het gebruikte algoritme) Een algoritme is een stappenplan bestaande uit een set regels in vaste volgorde om tot een oplossing te komen en het einddoel te bereiken.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Algoritme · Bekijk meer »

Aminozuur

Algemene structuur van α-aminozuren. De R staat voor residu-groep Een aminozuur is een organische verbinding die zowel een carboxygroep (-COOH) als een aminegroep (-NH2) bezit.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Aminozuur · Bekijk meer »

Arginine

Arginine (afgekort tot Arg of R) is een van de twintig natuurlijk voorkomende aminozuren.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Arginine · Bekijk meer »

Asparagine

Asparagine (afgekort tot Asn of N) is een van de twintig natuurlijk voorkomende aminozuren.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Asparagine · Bekijk meer »

Bio-informatica

NCBI-website). De samenstelling van het menselijk genoom is een van de grootste prestaties van de bio-informatica. Bio-informatica is de wetenschap die tot doel heeft de biologische kennis te verrijken door kennis uit de informatica toe te passen op biologische data.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Bio-informatica · Bekijk meer »

Biologie

Animalia - Oeros (''Bos primigenius taurus'') Plantae - Tarwe (''Triticum'') Fungi - Gewone morielje (''Morchella esculenta'') Virus - Gammafaag Biologie is de natuurwetenschap die zich richt op organismen, levensprocessen en levensverschijnselen.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Biologie · Bekijk meer »

BLAST

De Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is een algoritme dat gebruikt wordt voor het vergelijken (aligneren) van een DNA- of eiwit-sequentie in verscheidene databases.

Nieuw!!: Sequentiealignering en BLAST · Bekijk meer »

Boom (datastructuur)

Een boom of boomstructuur is een datastructuur in de informatica die een bijzonder geval van een graaf is.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Boom (datastructuur) · Bekijk meer »

Combinatie (wiskunde)

Er is binnen de wiskunde sprake van een combinatie als er k elementen worden gekozen uit een verzameling van n elementen, waarbij.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Combinatie (wiskunde) · Bekijk meer »

Complexiteitsgraad

De complexiteitsgraad van een bepaald algoritme is de manier waarop dat algoritme zich gedraagt als de grootte van het op te lossen probleem toeneemt.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Complexiteitsgraad · Bekijk meer »

Convergentie (wiskunde)

In de wiskunde is convergentie een eigenschap van sommige rijen dat naarmate men verder in de rij komt de elementen van de rij een bepaalde waarde blijken te naderen.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Convergentie (wiskunde) · Bekijk meer »

Deletie (genetica)

insertie, translocatie Een deletie is een mutatie waarbij een deel van de erfelijke code in een chromosoom ontbreekt.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Deletie (genetica) · Bekijk meer »

Dimensie (algemeen)

In het gewone spraakgebruik verstaan we onder de dimensies (van het Latijn: afmeting) van een voorwerp de parameters waarmee zijn vorm en afmetingen worden vastgelegd.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Dimensie (algemeen) · Bekijk meer »

DNA (biologie)

basenparen uitvergroot. Desoxyribonucleïnezuur, beter bekend als DNA,DNA is een afkorting van het Engelse deoxyribonucleic acid.

Nieuw!!: Sequentiealignering en DNA (biologie) · Bekijk meer »

Eiwitten

α-helices toont Eiwitten of proteïnen vormen een grote klasse van biologische moleculen, die bestaan uit polymere ketens van aminozuren.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Eiwitten · Bekijk meer »

Evolutie (biologie)

Evolutie is het proces van verandering in alle vormen van leven van generatie op generatie in populaties door overerving van kenmerken en eigenschappen met hun variatie en natuurlijke selectie.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Evolutie (biologie) · Bekijk meer »

Foutpositief en foutnegatief

Een foutpositief of valspositief testresultaat (Engels: false positive, Duits: Falsch-positiv) is een uitslag van een test/experiment die ten onrechte positief is.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Foutpositief en foutnegatief · Bekijk meer »

Frequentie

periode) Frequentie drukt uit hoe vaak iets gebeurt of voorkomt binnen een bepaalde tijd of in een zekere ruimte.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Frequentie · Bekijk meer »

Functie (wiskunde)

Grafiek van de functie f(x).

Nieuw!!: Sequentiealignering en Functie (wiskunde) · Bekijk meer »

Fylogenetische stamboom

rijken waar alle organismen onder vallen. Een fylogenetische stamboom is in de evolutiebiologie een schema dat de evolutionaire geschiedenis van een bepaalde groep verwante biologische soorten (of andere taxa) weergeeft.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Fylogenetische stamboom · Bekijk meer »

Geconserveerde sequentie

substitutie plaatsgevonden), of zelfs geheel niet geconserveerd. Geconserveerde sequenties zijn sequenties in nucleïnezuren (DNA en RNA) of eiwitten die tussen soorten overeenkomen (orthologe sequenties).

Nieuw!!: Sequentiealignering en Geconserveerde sequentie · Bekijk meer »

Genetische verwantschap (taalkunde)

De genetische verwantschap of taalverwantschap tussen talen is de mate waarin twee of meer geattesteerde talen als dochtertalen van een en dezelfde vooroudertaal beschouwd kunnen worden.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Genetische verwantschap (taalkunde) · Bekijk meer »

Heuristiek

Heuristiek (Grieks εὑρίσκειν.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Heuristiek · Bekijk meer »

Homologie (genetica)

Homologie (Grieks: homoios, hetzelfde en logos, woord, gedachte; homologia, overeenkomst) is het hebben van een gemeenschappelijke voorouder gemeten aan de hand van de overeenkomsten in de nucleotidesequentie in twee DNA- of RNA-moleculen of twee primaire structuren, de lineaire sequentie van aminozuren in eiwitten of peptides.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Homologie (genetica) · Bekijk meer »

Insertie (chromosomen)

inversie, insertie, translocatie Insertie is een toevoeging van een of meer nucleotiden aan een DNA- of RNA-sequentie.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Insertie (chromosomen) · Bekijk meer »

Iteratie

Iteratie is herhaling, iteratief is herhalend.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Iteratie · Bekijk meer »

Java (programmeertaal)

Java is een objectgeoriënteerde programmeertaal.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Java (programmeertaal) · Bekijk meer »

Lettergreepwoord

Een lettergreepwoord is een woord dat (meestal als afkorting) ontstaat doordat delen van verschillende bestaande woorden bestemd worden tot lettergrepen in een nieuwe combinatie.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Lettergreepwoord · Bekijk meer »

Matrix (wiskunde)

In de lineaire algebra, een deelgebied van de wiskunde, is een matrix, meervoud: matrices, een rechthoekig getallenschema.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Matrix (wiskunde) · Bekijk meer »

Matrixvermenigvuldiging

In de lineaire algebra is matrixvermenigvuldiging een bewerking tussen twee matrices die als resultaat een nieuwe matrix, aangeduid als het product van die twee matrices, oplevert.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Matrixvermenigvuldiging · Bekijk meer »

Mutatie (biologie)

Mutaties zijn wijzigingen in de erfelijke eigenschappen van het genoom (het DNA of RNA) van een cel.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Mutatie (biologie) · Bekijk meer »

National Center for Biotechnology Information

Het National Center for Biotechnology Information (NCBI) (Amerikaans Nationaal Centrum voor Biotechnologische Informatie) is deel van de Amerikaanse National Library of Medicine (NLM) die zelf een onderdeel vormt van de National Institutes of Health.

Nieuw!!: Sequentiealignering en National Center for Biotechnology Information · Bekijk meer »

Nucleotide

Nucleotiden vormen een groep van bio-organische verbindingen die de bouwstenen voor DNA en RNA vormen.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Nucleotide · Bekijk meer »

Opensourcesoftware

Logo van het Open Source Initiative Opensourcesoftware (soms ook openbronsoftware) is computerprogrammatuur waarvan de gebruiker de licentie heeft om de broncode te bestuderen, aan te passen, te verbeteren, te verspreiden of te verkopen.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Opensourcesoftware · Bekijk meer »

Sequentie (biologie)

In de biologie is een sequentie de eendimensionale volgorde van monomeren in een biopolymeer, bijvoorbeeld de volgorde van nucleotiden in een DNA- of RNA-molecuul, of de volgorde van aminozuren in een eiwit.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Sequentie (biologie) · Bekijk meer »

Soortvorming

De vier vormen van soortvorming: Allopatrische soortvorming, peripatrische soortvorming, parapatrische soortvorming en sympatrische soortvorming. Soortvorming of speciatie is het ontstaan van nieuwe (biologische) soorten uit populaties van bestaande soorten.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Soortvorming · Bekijk meer »

Statistiek

Statistiek is de wetenschap en de techniek van het verzamelen, bewerken, interpreteren en presenteren van gegevens.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Statistiek · Bekijk meer »

Structuur

Structuur is de manier waarop iets in elkaar zit, waarop elementen van een verzameling samenhangen.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Structuur · Bekijk meer »

Tekst

Een tekst is, ruim gedefinieerd, een reeks talige tekens, zoals letters, symbolen of klanken, die in een communicatieve situatie als een geheel wordt ervaren.

Nieuw!!: Sequentiealignering en Tekst · Bekijk meer »

Richt hier:

Sequence alignment, Sequentie-alignering, Sequentie-uitlijning.

UitgaandeInkomende
Hey! We zijn op Facebook nu! »